清华大学自主招生和领军计划选拔的对象不同。自主招生旨在选拔有各类突出特长及创新潜质的人才，而领军计划是面向平时学习成绩优秀的学生，凡志向远大、追求卓越、品学兼优、素质全面的高中毕业生均可申请，在评审时特别注重高中阶段特别是高三以来的综合学业成绩。清华大学领军计划在报考类型及志愿填报要求中，学生首先需在“招生类型”中选择“综合评价”、“报考类型”中选择“领军人才选拔”；其次学生可不受自身文理分科限制进行学科类型申请，每人最多允许填报3个专业类（方向）；最后申请参加专业特色选拔项目的学生需将第一专业志愿填写为对应的专业类（方向）。
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