自主招生的核心价值在于，为高校选拔与其办学理念、办学特色、价值观念和培养模式相适应的人才提供了机会，因而为高校招收具有创新潜质、学科特长（俗称偏才怪才），以及全面发展、综合素质较高的拔尖人才提供了可能，打破了高考招生录取“以一把尺子统天下”、“以分数论英雄”的人才评价与选拔模式。
十多年来，自主招生试点高校积极探索，不断创新选拔模式，录取了一大批具有创新潜质或综合素质优秀的学生。作为高考制度的重要组成部分，自主招生已被社会所接受。然而，由于自主招生的复杂性、高利害性、高关注度等使其一直饱受诟病，掐尖、抢生源、联盟“三国杀”、小高考、校长实名推荐等有关自主招生的话题层出不穷。笔者认为，之所以备受关注源自以下三个方面。
首先是报考机会的公平性问题。教育部规定高校自主招生名额不能超过总招生计划的5%，加上自主选拔的对象又定位在具有学科特长的偏才怪才，在这样的背景下，不可能所有的高中毕业生都具备报名资格，因而中学如何推荐、高校如何认定学生的报名资格就成为社会关注话题。例如，校长实名推荐制就曾备受争议，人们对校长能否真正推荐优秀学生，如何确保公平公正，推荐标准是否科学等问题一直心存疑虑，甚至质疑部分校长是否因为压力而违心推荐，或因为私利而造假推荐。事实上，许多中学校长为了避免社会产生质疑，还是回到了按分数排队的老路上。2015年，教育部明确规定取消校长实名推荐的做法，也正是为了从源头上消除机会不公、权力滥用的问题。
其次是评价体系及方法。这是实现自主招生初衷的核心问题。国家将自主招生定位于选拔具有学科特长、创新潜质、综合素质优秀的高潜人才。
